医院设有呼吸科、消化科、肾病科、内分泌科、血液科、老干部病房肿瘤科、中西医结合糖尿病科、传染科、ICU特需病房、神经康复病区、神经介入病区、神经内科、血液净化中心、心内科、普外科、胆道普外科、肝脏普外科、骨科、胸外科、神经外科、泌尿外科、烧伤科、眼科、乳腺外科、手术麻醉科、肛肠皮肤科、耳鼻喉科、心脏外科、整形外科、血管外科、小儿外科、口腔科、妇科、妇幼预防保健科、妇科、门诊产科、产房生殖中心、儿科、重症监护病房新生儿重症监护病区新生儿病区儿科、门诊小儿脑瘫康复科、放射科、核磁共振室放疗科、检验科、输血科、营养科、超声科、中心腔镜室病理细胞室脑电图室静配中心中医门诊碎石中心核医学肺功能室急诊外科、针灸科、中药科、内科、门诊口腔科、门诊CT室器械科、理疗科、急诊内科、心电生理室、病理室、皮肤门诊、西药科等临床和医技科室。
一、河南省临床医学重点学科：心血管内科学、普通外科学、肿瘤内科学。
二、河南省临床医学重点（培养）学科：耳鼻咽喉科学、神经病学、神经外科学、感染性疾病学、内分泌学、消化病学、肾脏病学。
三、河南省医学重点专科：胆道普外科、胸外科。
四、河南省医学重点培育专科：神经外科。
五、南阳市重点专科：消化科、内分泌代谢科、神经外科、肿瘤科、产二科、耳鼻喉科。
六、南阳市重点学科：小儿外科。
一、优势病种：肝癌、肝门部胆管癌、胆囊癌、壶腹周围癌、肝硬化、各种肠炎、不全性肠梗阻、上下消化道出血、垂体疾病、肾上腺、性腺疾病、肥胖、骨质疏松、生长发育异常、肺癌、胃癌、乳腺癌、食道癌、大肠癌、肝癌、恶性淋巴瘤。
二、优势技术：腹腔镜消化性溃疡穿孔修补术、腹腔镜肠粘连分离术、腹腔镜阑尾切除术、食管癌的颈部机械吻合术、三野淋巴结清扫、管状胃技术、结（空）肠代食管术、微创穿刺引流术、显微镜下微创血肿清除术、小骨窗微创术、食道良恶性狭窄扩张与支架置入术、内镜下止血夹止血。
